โรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม เดิมเป็นสาขาของโรงเรียนนาเชือกพิทยาสรรค์ โดยมี นายประพันธ์        ภาภิรมย์  เป็นผู้อำนวยการได้มอบหมายให้ นายอดิศักดิ์  มุ่งชู ตำแหน่งอาจารย์ 1 ระดับ 4 ทำหน้าที่เป็นผู้ประสานงาน จัดตั้งขึ้นเมื่อ ปี พ.ศ. 2534 ที่โรงเรียนบ้านคึมบง โดยเปิดรับนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 จำนวน 35 คน และครู-อาจารย์ จากโรงเรียนนาเชือกพิทยาสรรค์ และจากโรงเรียนบ้านคึมบงไปช่วยสอน
 ในปีการศึกษา 2535 สภาตำบลหนองโพธิ์ โดยการนำของ นายทองสา  ธรรมกาโร ประธานสภาตำบล ร่วมกับชาวบ้านหนองโพธิ์ได้ปรึกษาหารือกันให้ย้ายจาก โรงเรียนบ้านคึมบงไปอยู่บริเวณโนนสวนหลวง บ้านหนองโพธิ์ หมู่ที่ 1 ตำบลหนองโพธิ์ อำเภอนาเชือก จังหวัดมหาสารคาม มีพื้นที่จำนวน 51 ไร่  ชาวบ้านตำบลหนองโพธิ์ให้ความอนุเคราะห์สนับสนุนจัดสร้างอาคารชั่วคราวให้ 1 หลัง
ในวันที่ 8 กุมภาพันธ์ 2536 กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศจัดตั้งสาขาโรงเรียนนาเชือกพิทยาสรรค์ เป็นโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม กรมสามัญศึกษาได้จัดสรรงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบเบ็ดเสร็จ ก ข ค บ้านพักครู 2 หลัง บ้านพักนักการภารโรง 1 หลัง ห้องน้ำห้องส้วม 2 หลัง และได้รับความอนุเคราะห์จากพระครูโฆสิตธรรมภานี บริจาคโอ่งน้ำขนาดใหญ่จำนวน 12 ใบ และพระบูชา 1 องค์ ในปีนี้โรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคมได้เปิดสอนถึงระดับมัธยมศึกษาปีที่ 3 และกรมสามัญศึกษามีคำสั่งแต่งตั้งให้ นายอดิศักดิ์ มุ่งชู ดำรงตำแหน่งครูใหญ่โรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม เป็นคนแรก ในวันที่ 29 ธันวาคม 2538 นายอดิศักดิ์ มุ่งชู ได้รับแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ ในวันที่ 1 ตุลาคม 2540 และได้รับแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการ
 ในปี พ.ศ. 2539 ได้รับจัดสรรงบประมาณก่อสร้างอาคารเรียนแบบ 108 ล จำนวน 1 หลัง บ้านพักนักเรียนพร้อมอาคารประกอบ จำนวน 1 ชุด
 วันที่ 19 กุมภาพันธ์ 2541 กรมสามัญศึกษาได้มีคำสั่งให้นายเกิด บรรยงวรพินิจ ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม   ในวันที่ 20 มีนาคม 2542 ได้รับเงินบริจาค จากการจัดงานผ้าป่าการศึกษา จำนวน 363,615 บาท และได้นำเงินดังกล่าวมาต่อเติมอาคาร 108 ล เป็นอาคารเรียนและสำนักงานประกอบการเรียนการสอน
วันที่ 19 กุมภาพันธ์ 2541  โรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคมได้โอนย้ายไปเป็นโรงเรียนในสังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม  โดยมีนางสาวนิอร  ประมูลจักโก  รักษาราชการแทนในตำแหน่งผู้อำนวยการ
วันที่ 19 กุมภาพันธ์ 2552  องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม   ได้มีคำสั่งให้ 
นายองอาจ  สว่างทิศ  ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม  


วันที่ 14 มีนาคม 2553  องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม   ได้มีคำสั่งให้ 
นายตรีวิเศษ  ทัพไทย  ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม  
วันที่ 15 มีนาคม 2554 องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม    ได้มีคำสั่งให้
นายเสงี่ยม  นันทะแสน  ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม
วันที่ 4 ธันวาคม2556  องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม    ได้มีคำสั่งให้
นายสวานิตย์  ศิริบูรณ์  ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม
วันที่ 31 สิงหาคม 2559 องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม    ได้มีคำสั่งให้
นางสาวนิอร ประมูลจักโก  รักษาราชการแทนในตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม
           วันที่ 21 สิงหาคม 2560 องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม    ได้มีคำสั่งให้
นางแววดาว  พานดวงแก้ว  ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม
วันที่ ๓ ตุลาคม ๒๕๖๕  องค์การบริหารส่วนจังหวัดมหาสารคาม   ได้มีคำสั่งให้ 
นายตรีวิเศษ  ทัพไทย  ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนหนองโพธิ์วิทยาคม